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前言

本期将介绍如何使用R检验实验数据的正态分布

编者经常看到一些期刊文章的作者将Spearman相关性和Pearson相关性混淆,或许是为了让研究数据更有说服力,但我们还是要进行正态性检验,以便在分析前得到可靠的解释和分析结果。

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概念介绍

皮尔逊相关性要求 X 和 Y 都是连续变量,并且都来自正态分布的受试者; T-test等方法通常用于进一步检验Pearson相关系数k-s检验正态分布结果怎么看,T-test是基于数据是正态的假设。

斯皮尔曼相关不需要变量,可以使用连续变量或秩变量。

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研究数据时如何选择相关的统计方法?

对于连续数据、正态分布和线性相关,Pearson 系数最合适。 当然,使用斯皮尔曼系数没有错,但统计效率没有皮尔逊相关高;

只要不满足以上三个条件中的任何一个,就必须使用 Spearman 相关系数,而不能使用 Pearson 系数。

# 调用R包
library(tidyverse) # 管理数据表
library(ggpubr) # 快速绘图
library(rstatix) # 统计分析

#数据读取
options(stringsAsFactors=F)# R中环境变量设置,防止字符型变量转换为因子
# 读入环境因子数据表
ENV=read.csv("varechem.csv",header = T,row.names = 1)
head(ENV) # 查看数据前几行

密度图测试(Density plot)

#可视化正态分布检验
# 环境因子数据
p1 <- ggdensity(ENV$TN, fill = "lightgray")#以TN为例
pdf("环境因子TN-密度图.pdf",height =4,width = 4)
p1
dev.off()

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QQ图(如果数据呈正态分布,则点应在置信区间内形成一条直线。)

# 环境因子数据
p2 <- ggqqplot(ENV$TN#以TN为例
pdf("环境因子TN-QQ图.pdf",height =4,width = 4)
p2
dev.off()

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正态分布的显着性检验

可视化数据的方法。 因为它不能给出一个确定的结果。 用肉眼观察分布形状来检查数据是否服从正态分布通常是不可靠的。

# 单变量正态性检验(以单一变量TN说明)
ENV %>% shapiro_test(TN) 

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# 多变量正态性检验
assign("M",names(ENV[,1:16])) # 将环境因子名称,赋于M
M
ENV %>% shapiro_test(M) # 对名称包括在M中的的环境因子进行shapiro test

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【20220409期】《判断你的SCI论文是否混淆Spearman和Pearson并检验数据正态分布+建议》

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编辑| 灵正堂

投稿 | 不想工作的Peggy Tong

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